Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GopcQ8BH60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GopcQ8BH60 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GopcQ8BH60 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GopcQ8BH60 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GopcQ8BH60 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GopcQ8BH60 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GopcQ8BH60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GopcQ8BH60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GopcQ8BH60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GopcQ8BH60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GopcQ8BH60 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GopcQ8BH60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GopcQ8BH60 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GopcQ8BH60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms