Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH58

Tiprl, TIP41-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiprlQ8BH58 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TiprlQ8BH58 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TiprlQ8BH58 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TiprlQ8BH58 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TiprlQ8BH58 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TiprlQ8BH58 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TiprlQ8BH58 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TiprlQ8BH58 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TiprlQ8BH58 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TiprlQ8BH58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TiprlQ8BH58 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TiprlQ8BH58 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TiprlQ8BH58 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TiprlQ8BH58 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms