Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Tmco3Q8BH01 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Tmco3Q8BH01 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tmco3Q8BH01 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Tmco3Q8BH01 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Tmco3Q8BH01 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Tmco3Q8BH01 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Tmco3Q8BH01 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Tmco3Q8BH01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tmco3Q8BH01 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Tmco3Q8BH01 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Tmco3Q8BH01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Tmco3Q8BH01 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Tmco3Q8BH01 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tmco3Q8BH01 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tmco3Q8BH01 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Tmco3Q8BH01 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tmco3Q8BH01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Tmco3Q8BH01 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65,2 ms