Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Htatsf1Q8BGC0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Htatsf1Q8BGC0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Htatsf1Q8BGC0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Htatsf1Q8BGC0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Htatsf1Q8BGC0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Htatsf1Q8BGC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Htatsf1Q8BGC0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Htatsf1Q8BGC0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Htatsf1Q8BGC0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Htatsf1Q8BGC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Htatsf1Q8BGC0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Htatsf1Q8BGC0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Htatsf1Q8BGC0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Htatsf1Q8BGC0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Htatsf1Q8BGC0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Htatsf1Q8BGC0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Htatsf1Q8BGC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Htatsf1Q8BGC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Htatsf1Q8BGC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Htatsf1Q8BGC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Htatsf1Q8BGC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Htatsf1Q8BGC0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Htatsf1Q8BGC0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Htatsf1Q8BGC0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Htatsf1Q8BGC0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms