Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms