Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx32Q80ZJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx32Q80ZJ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx32Q80ZJ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx32Q80ZJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx32Q80ZJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx32Q80ZJ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx32Q80ZJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx32Q80ZJ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx32Q80ZJ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx32Q80ZJ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx32Q80ZJ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx32Q80ZJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx32Q80ZJ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx32Q80ZJ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx32Q80ZJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx32Q80ZJ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx32Q80ZJ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx32Q80ZJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms