Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ckap2lQ7TS74 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ckap2lQ7TS74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ckap2lQ7TS74 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ckap2lQ7TS74 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap2lQ7TS74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2lQ7TS74 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ckap2lQ7TS74 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ckap2lQ7TS74 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms