Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScocQ78YZ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScocQ78YZ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScocQ78YZ6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScocQ78YZ6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScocQ78YZ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScocQ78YZ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ScocQ78YZ6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ScocQ78YZ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScocQ78YZ6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScocQ78YZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScocQ78YZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ScocQ78YZ6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScocQ78YZ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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