Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GypcQ78HU7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GypcQ78HU7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GypcQ78HU7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GypcQ78HU7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GypcQ78HU7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GypcQ78HU7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GypcQ78HU7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GypcQ78HU7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GypcQ78HU7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms