Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Efr3bQ6ZQ18 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Efr3bQ6ZQ18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Efr3bQ6ZQ18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Efr3bQ6ZQ18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Efr3bQ6ZQ18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Efr3bQ6ZQ18 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efr3bQ6ZQ18 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Efr3bQ6ZQ18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Efr3bQ6ZQ18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efr3bQ6ZQ18 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Efr3bQ6ZQ18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efr3bQ6ZQ18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efr3bQ6ZQ18 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efr3bQ6ZQ18 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efr3bQ6ZQ18 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efr3bQ6ZQ18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Efr3bQ6ZQ18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efr3bQ6ZQ18 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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