Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chsy1Q6ZQ11 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chsy1Q6ZQ11 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chsy1Q6ZQ11 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chsy1Q6ZQ11 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chsy1Q6ZQ11 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chsy1Q6ZQ11 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chsy1Q6ZQ11 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chsy1Q6ZQ11 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Chsy1Q6ZQ11 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chsy1Q6ZQ11 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chsy1Q6ZQ11 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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