Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zc3h4Q6ZPZ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Zc3h4Q6ZPZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zc3h4Q6ZPZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zc3h4Q6ZPZ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zc3h4Q6ZPZ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zc3h4Q6ZPZ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zc3h4Q6ZPZ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zc3h4Q6ZPZ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zc3h4Q6ZPZ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zc3h4Q6ZPZ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zc3h4Q6ZPZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zc3h4Q6ZPZ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zc3h4Q6ZPZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zc3h4Q6ZPZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms