Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg5Q6ZPY2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smg5Q6ZPY2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg5Q6ZPY2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg5Q6ZPY2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg5Q6ZPY2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smg5Q6ZPY2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg5Q6ZPY2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms