Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfap2eQ6VUP9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2eQ6VUP9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2eQ6VUP9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2eQ6VUP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2eQ6VUP9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2eQ6VUP9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2eQ6VUP9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.3 ms