Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sarm1Q6PDS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sarm1Q6PDS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sarm1Q6PDS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sarm1Q6PDS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sarm1Q6PDS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sarm1Q6PDS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sarm1Q6PDS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sarm1Q6PDS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sarm1Q6PDS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sarm1Q6PDS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sarm1Q6PDS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sarm1Q6PDS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sarm1Q6PDS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sarm1Q6PDS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sarm1Q6PDS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sarm1Q6PDS3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sarm1Q6PDS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sarm1Q6PDS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sarm1Q6PDS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sarm1Q6PDS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sarm1Q6PDS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sarm1Q6PDS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sarm1Q6PDS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sarm1Q6PDS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms