Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Trim37Q6PCX9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Trim37Q6PCX9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Trim37Q6PCX9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Trim37Q6PCX9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Trim37Q6PCX9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Trim37Q6PCX9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Trim37Q6PCX9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Trim37Q6PCX9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Trim37Q6PCX9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Trim37Q6PCX9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Trim37Q6PCX9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Trim37Q6PCX9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Trim37Q6PCX9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Trim37Q6PCX9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Trim37Q6PCX9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Trim37Q6PCX9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Trim37Q6PCX9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Trim37Q6PCX9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Trim37Q6PCX9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Trim37Q6PCX9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Trim37Q6PCX9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Trim37Q6PCX9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Trim37Q6PCX9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trim37Q6PCX9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trim37Q6PCX9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Trim37Q6PCX9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Trim37Q6PCX9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim37Q6PCX9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim37Q6PCX9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim37Q6PCX9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Trim37Q6PCX9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim37Q6PCX9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Trim37Q6PCX9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Trim37Q6PCX9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim37Q6PCX9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim37Q6PCX9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim37Q6PCX9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim37Q6PCX9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Trim37Q6PCX9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Trim37Q6PCX9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim37Q6PCX9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim37Q6PCX9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim37Q6PCX9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim37Q6PCX9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,52■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Trim37Q6PCX9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Trim37Q6PCX9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim37Q6PCX9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim37Q6PCX9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim37Q6PCX9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim37Q6PCX9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms