Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx6Q6P8X1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx6Q6P8X1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx6Q6P8X1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx6Q6P8X1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx6Q6P8X1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx6Q6P8X1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx6Q6P8X1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx6Q6P8X1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx6Q6P8X1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx6Q6P8X1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx6Q6P8X1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx6Q6P8X1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx6Q6P8X1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx6Q6P8X1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx6Q6P8X1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx6Q6P8X1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx6Q6P8X1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms