Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ScapQ6GQT6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ScapQ6GQT6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ScapQ6GQT6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ScapQ6GQT6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ScapQ6GQT6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScapQ6GQT6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScapQ6GQT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScapQ6GQT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ScapQ6GQT6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ScapQ6GQT6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ScapQ6GQT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ScapQ6GQT6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ScapQ6GQT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ScapQ6GQT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ScapQ6GQT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ScapQ6GQT6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScapQ6GQT6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScapQ6GQT6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScapQ6GQT6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ScapQ6GQT6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ScapQ6GQT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ScapQ6GQT6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ScapQ6GQT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScapQ6GQT6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScapQ6GQT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ScapQ6GQT6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ScapQ6GQT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ScapQ6GQT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ScapQ6GQT6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScapQ6GQT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScapQ6GQT6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScapQ6GQT6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ScapQ6GQT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ScapQ6GQT6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ScapQ6GQT6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms