Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep290Q6A078 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep290Q6A078 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep290Q6A078 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep290Q6A078 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep290Q6A078 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep290Q6A078 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep290Q6A078 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep290Q6A078 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep290Q6A078 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep290Q6A078 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep290Q6A078 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep290Q6A078 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep290Q6A078 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep290Q6A078 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep290Q6A078 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cep290Q6A078 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep290Q6A078 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep290Q6A078 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep290Q6A078 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep290Q6A078 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep290Q6A078 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep290Q6A078 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep290Q6A078 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep290Q6A078 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep290Q6A078 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep290Q6A078 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep290Q6A078 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep290Q6A078 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep290Q6A078 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep290Q6A078 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep290Q6A078 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep290Q6A078 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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