Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc3Q64519 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdc3Q64519 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdc3Q64519 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc3Q64519 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sdc3Q64519 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc3Q64519 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc3Q64519 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms