Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn13Q64512 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn13Q64512 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn13Q64512 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn13Q64512 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn13Q64512 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn13Q64512 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn13Q64512 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn13Q64512 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn13Q64512 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn13Q64512 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn13Q64512 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn13Q64512 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn13Q64512 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn13Q64512 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn13Q64512 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn13Q64512 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn13Q64512 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn13Q64512 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn13Q64512 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn13Q64512 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptpn13Q64512 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn13Q64512 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn13Q64512 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn13Q64512 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn13Q64512 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn13Q64512 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn13Q64512 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn13Q64512 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn13Q64512 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn13Q64512 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn13Q64512 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn13Q64512 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn13Q64512 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn13Q64512 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms