Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou4f3Q63955 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pou4f3Q63955 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f3Q63955 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou4f3Q63955 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou4f3Q63955 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou4f3Q63955 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou4f3Q63955 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms