Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spock1Q62288 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock1Q62288 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock1Q62288 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Spock1Q62288 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spock1Q62288 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spock1Q62288 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock1Q62288 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spock1Q62288 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spock1Q62288 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spock1Q62288 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Spock1Q62288 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spock1Q62288 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spock1Q62288 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms