Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms