Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsx2Q61412 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsx2Q61412 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsx2Q61412 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vsx2Q61412 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsx2Q61412 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsx2Q61412 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vsx2Q61412 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vsx2Q61412 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms