Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcolceQ61398 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PcolceQ61398 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PcolceQ61398 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PcolceQ61398 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcolceQ61398 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcolceQ61398 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms