Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvr1bQ61271 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acvr1bQ61271 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acvr1bQ61271 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Acvr1bQ61271 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acvr1bQ61271 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acvr1bQ61271 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms