Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PapolaQ61183 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PapolaQ61183 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PapolaQ61183 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PapolaQ61183 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PapolaQ61183 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PapolaQ61183 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PapolaQ61183 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PapolaQ61183 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PapolaQ61183 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PapolaQ61183 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PapolaQ61183 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PapolaQ61183 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PapolaQ61183 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PapolaQ61183 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PapolaQ61183 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.5 ms