Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprnQ60673 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprnQ60673 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprnQ60673 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprnQ60673 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprnQ60673 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprnQ60673 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprnQ60673 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprnQ60673 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprnQ60673 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprnQ60673 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprnQ60673 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprnQ60673 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprnQ60673 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms