Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Specc1Q5SXY1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Specc1Q5SXY1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Specc1Q5SXY1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Specc1Q5SXY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Specc1Q5SXY1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Specc1Q5SXY1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Specc1Q5SXY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Specc1Q5SXY1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Specc1Q5SXY1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Specc1Q5SXY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Specc1Q5SXY1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Specc1Q5SXY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Specc1Q5SXY1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Specc1Q5SXY1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Specc1Q5SXY1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Specc1Q5SXY1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Specc1Q5SXY1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Specc1Q5SXY1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Specc1Q5SXY1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Specc1Q5SXY1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Specc1Q5SXY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Specc1Q5SXY1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Specc1Q5SXY1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Specc1Q5SXY1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Specc1Q5SXY1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Specc1Q5SXY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Specc1Q5SXY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Specc1Q5SXY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Specc1Q5SXY1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Specc1Q5SXY1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Specc1Q5SXY1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Specc1Q5SXY1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Specc1Q5SXY1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Specc1Q5SXY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Specc1Q5SXY1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Specc1Q5SXY1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Specc1Q5SXY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Specc1Q5SXY1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Specc1Q5SXY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Specc1Q5SXY1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Specc1Q5SXY1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Specc1Q5SXY1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Specc1Q5SXY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Specc1Q5SXY1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms