Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWU9

Acaca, Acetyl-CoA carboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcacaQ5SWU9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AcacaQ5SWU9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AcacaQ5SWU9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AcacaQ5SWU9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AcacaQ5SWU9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AcacaQ5SWU9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AcacaQ5SWU9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AcacaQ5SWU9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AcacaQ5SWU9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AcacaQ5SWU9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AcacaQ5SWU9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AcacaQ5SWU9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AcacaQ5SWU9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AcacaQ5SWU9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AcacaQ5SWU9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AcacaQ5SWU9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AcacaQ5SWU9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AcacaQ5SWU9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AcacaQ5SWU9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AcacaQ5SWU9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AcacaQ5SWU9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AcacaQ5SWU9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AcacaQ5SWU9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AcacaQ5SWU9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AcacaQ5SWU9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AcacaQ5SWU9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AcacaQ5SWU9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms