Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Tns3Q5SSZ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Tns3Q5SSZ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Tns3Q5SSZ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Tns3Q5SSZ5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Tns3Q5SSZ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Tns3Q5SSZ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Tns3Q5SSZ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Tns3Q5SSZ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Tns3Q5SSZ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Tns3Q5SSZ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Tns3Q5SSZ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Tns3Q5SSZ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Tns3Q5SSZ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tns3Q5SSZ5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tns3Q5SSZ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Tns3Q5SSZ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tns3Q5SSZ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tns3Q5SSZ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Tns3Q5SSZ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tns3Q5SSZ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tns3Q5SSZ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tns3Q5SSZ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Tns3Q5SSZ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Tns3Q5SSZ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Tns3Q5SSZ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Tns3Q5SSZ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tns3Q5SSZ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Tns3Q5SSZ5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tns3Q5SSZ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Tns3Q5SSZ5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tns3Q5SSZ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Tns3Q5SSZ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Tns3Q5SSZ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Tns3Q5SSZ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tns3Q5SSZ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Tns3Q5SSZ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Tns3Q5SSZ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Tns3Q5SSZ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Tns3Q5SSZ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Tns3Q5SSZ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Tns3Q5SSZ5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Tns3Q5SSZ5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Tns3Q5SSZ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tns3Q5SSZ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Tns3Q5SSZ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Tns3Q5SSZ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Tns3Q5SSZ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Tns3Q5SSZ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Tns3Q5SSZ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Tns3Q5SSZ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Tns3Q5SSZ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Tns3Q5SSZ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tns3Q5SSZ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tns3Q5SSZ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Tns3Q5SSZ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Tns3Q5SSZ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Tns3Q5SSZ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tns3Q5SSZ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms