Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam20cQ5MJS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20cQ5MJS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20cQ5MJS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20cQ5MJS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20cQ5MJS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam20cQ5MJS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20cQ5MJS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20cQ5MJS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20cQ5MJS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms