Protein–RNA interactions for Protein: Q5I0V9

2900092C05Rik, RIKEN cDNA 2900092C05, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900092C05RikQ5I0V9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2900092C05RikQ5I0V9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
2900092C05RikQ5I0V9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
2900092C05RikQ5I0V9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2900092C05RikQ5I0V9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2900092C05RikQ5I0V9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2900092C05RikQ5I0V9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms