Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms