Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc3Q5DU56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc3Q5DU56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc3Q5DU56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc3Q5DU56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc3Q5DU56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc3Q5DU56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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