Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ankrd28Q505D1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd28Q505D1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd28Q505D1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd28Q505D1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd28Q505D1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd28Q505D1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd28Q505D1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd28Q505D1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd28Q505D1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd28Q505D1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd28Q505D1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd28Q505D1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd28Q505D1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ankrd28Q505D1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms