Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Phactr4Q501J7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Phactr4Q501J7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phactr4Q501J7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Phactr4Q501J7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Phactr4Q501J7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phactr4Q501J7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phactr4Q501J7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Phactr4Q501J7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phactr4Q501J7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms