Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil2Q3V3V9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Carmil2Q3V3V9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil2Q3V3V9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil2Q3V3V9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil2Q3V3V9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil2Q3V3V9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil2Q3V3V9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil2Q3V3V9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil2Q3V3V9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil2Q3V3V9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil2Q3V3V9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Carmil2Q3V3V9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil2Q3V3V9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil2Q3V3V9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil2Q3V3V9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil2Q3V3V9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil2Q3V3V9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil2Q3V3V9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil2Q3V3V9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil2Q3V3V9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil2Q3V3V9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms