Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnah12Q3V0Q1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnah12Q3V0Q1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnah12Q3V0Q1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnah12Q3V0Q1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnah12Q3V0Q1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnah12Q3V0Q1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnah12Q3V0Q1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnah12Q3V0Q1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnah12Q3V0Q1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnah12Q3V0Q1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnah12Q3V0Q1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnah12Q3V0Q1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnah12Q3V0Q1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnah12Q3V0Q1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnah12Q3V0Q1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnah12Q3V0Q1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnah12Q3V0Q1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnah12Q3V0Q1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnah12Q3V0Q1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnah12Q3V0Q1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnah12Q3V0Q1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnah12Q3V0Q1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnah12Q3V0Q1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnah12Q3V0Q1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnah12Q3V0Q1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnah12Q3V0Q1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnah12Q3V0Q1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnah12Q3V0Q1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnah12Q3V0Q1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnah12Q3V0Q1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnah12Q3V0Q1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms