Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ttc9Q3V038 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc9Q3V038 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttc9Q3V038 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc9Q3V038 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc9Q3V038 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc9Q3V038 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc9Q3V038 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc9Q3V038 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc9Q3V038 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc9Q3V038 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc9Q3V038 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc9Q3V038 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc9Q3V038 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc9Q3V038 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc9Q3V038 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc9Q3V038 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc9Q3V038 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc9Q3V038 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttc9Q3V038 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc9Q3V038 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc9Q3V038 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc9Q3V038 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc9Q3V038 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc9Q3V038 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc9Q3V038 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc9Q3V038 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc9Q3V038 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc9Q3V038 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms