Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ankrd13cQ3UX43 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ankrd13cQ3UX43 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Ankrd13cQ3UX43 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Ankrd13cQ3UX43 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ankrd13cQ3UX43 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Ankrd13cQ3UX43 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ankrd13cQ3UX43 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ankrd13cQ3UX43 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ankrd13cQ3UX43 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ankrd13cQ3UX43 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ankrd13cQ3UX43 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ankrd13cQ3UX43 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ankrd13cQ3UX43 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Ankrd13cQ3UX43 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ankrd13cQ3UX43 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ankrd13cQ3UX43 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Ankrd13cQ3UX43 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ankrd13cQ3UX43 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ankrd13cQ3UX43 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ankrd13cQ3UX43 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Ankrd13cQ3UX43 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ankrd13cQ3UX43 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ankrd13cQ3UX43 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ankrd13cQ3UX43 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ankrd13cQ3UX43 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ankrd13cQ3UX43 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ankrd13cQ3UX43 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ankrd13cQ3UX43 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ankrd13cQ3UX43 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ankrd13cQ3UX43 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ankrd13cQ3UX43 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ankrd13cQ3UX43 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ankrd13cQ3UX43 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ankrd13cQ3UX43 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ankrd13cQ3UX43 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Ankrd13cQ3UX43 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Ankrd13cQ3UX43 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ankrd13cQ3UX43 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ankrd13cQ3UX43 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ankrd13cQ3UX43 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ankrd13cQ3UX43 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ankrd13cQ3UX43 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ankrd13cQ3UX43 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ankrd13cQ3UX43 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ankrd13cQ3UX43 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,8 ms