Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mccc2Q3ULD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mccc2Q3ULD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mccc2Q3ULD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mccc2Q3ULD5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mccc2Q3ULD5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mccc2Q3ULD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mccc2Q3ULD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mccc2Q3ULD5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mccc2Q3ULD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mccc2Q3ULD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mccc2Q3ULD5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mccc2Q3ULD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mccc2Q3ULD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mccc2Q3ULD5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms