Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ulk3Q3U3Q1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Ulk3Q3U3Q1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ulk3Q3U3Q1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ulk3Q3U3Q1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ulk3Q3U3Q1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23,64■■□□□ 1,38
Ulk3Q3U3Q1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
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