Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Srebf2Q3U1N2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Srebf2Q3U1N2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Srebf2Q3U1N2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Srebf2Q3U1N2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Srebf2Q3U1N2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Srebf2Q3U1N2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Srebf2Q3U1N2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Srebf2Q3U1N2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Srebf2Q3U1N2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Srebf2Q3U1N2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Srebf2Q3U1N2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Srebf2Q3U1N2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Srebf2Q3U1N2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Srebf2Q3U1N2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Srebf2Q3U1N2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Srebf2Q3U1N2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Srebf2Q3U1N2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Srebf2Q3U1N2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Srebf2Q3U1N2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Srebf2Q3U1N2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Srebf2Q3U1N2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Srebf2Q3U1N2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Srebf2Q3U1N2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Srebf2Q3U1N2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Srebf2Q3U1N2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Srebf2Q3U1N2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Srebf2Q3U1N2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Srebf2Q3U1N2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Srebf2Q3U1N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Srebf2Q3U1N2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Srebf2Q3U1N2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Srebf2Q3U1N2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Srebf2Q3U1N2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Srebf2Q3U1N2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Srebf2Q3U1N2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Srebf2Q3U1N2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Srebf2Q3U1N2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Srebf2Q3U1N2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Srebf2Q3U1N2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Srebf2Q3U1N2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Srebf2Q3U1N2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Srebf2Q3U1N2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Srebf2Q3U1N2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Srebf2Q3U1N2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Srebf2Q3U1N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Srebf2Q3U1N2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Srebf2Q3U1N2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Srebf2Q3U1N2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Srebf2Q3U1N2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Srebf2Q3U1N2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Srebf2Q3U1N2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Srebf2Q3U1N2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Srebf2Q3U1N2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Srebf2Q3U1N2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Srebf2Q3U1N2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Srebf2Q3U1N2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms