Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XylbQ3TNA1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XylbQ3TNA1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XylbQ3TNA1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XylbQ3TNA1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XylbQ3TNA1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XylbQ3TNA1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XylbQ3TNA1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XylbQ3TNA1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms