Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vax1Q2NKI2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vax1Q2NKI2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vax1Q2NKI2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vax1Q2NKI2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vax1Q2NKI2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vax1Q2NKI2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vax1Q2NKI2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vax1Q2NKI2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vax1Q2NKI2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vax1Q2NKI2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vax1Q2NKI2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vax1Q2NKI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vax1Q2NKI2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vax1Q2NKI2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vax1Q2NKI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vax1Q2NKI2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vax1Q2NKI2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vax1Q2NKI2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vax1Q2NKI2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vax1Q2NKI2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vax1Q2NKI2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vax1Q2NKI2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vax1Q2NKI2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vax1Q2NKI2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms