Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spatc1Q148B6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spatc1Q148B6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spatc1Q148B6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spatc1Q148B6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spatc1Q148B6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spatc1Q148B6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms