Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.113e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 314.62□□□□□ -0.072e-21■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-21■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 CCNL2-219ENST00000497013 548 ntTSL 213.97□□□□□ -0.173e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 413.97□□□□□ -0.172e-21■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 DOCK6-203ENST00000585904 554 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 SYNGR2-209ENST00000592456 3036 nt13.49□□□□□ -0.253e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 DOCK6-212ENST00000590680 1391 ntTSL 512.76□□□□□ -0.373e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 RPS19-205ENST00000598466 601 ntTSL 211.21□□□□□ -0.613e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 GOLGA2-205ENST00000462089 766 ntTSL 310.86□□□□□ -0.673e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 DOCK6-211ENST00000590452 231 ntTSL 39.39□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.933e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.953e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 56.71□□□□□ -1.343e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 REV1-208ENST00000472000 778 ntTSL 26.66□□□□□ -1.343e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 REV1-214ENST00000485487 866 ntTSL 25.57□□□□□ -1.523e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 REV1-207ENST00000465835 3172 ntTSL 55.34□□□□□ -1.553e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 REV1-210ENST00000477121 564 ntTSL 34.5□□□□□ -1.693e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 REV1-204ENST00000438366 545 ntTSL 34.09□□□□□ -1.753e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 INTS11-245ENST00000533916 405 ntTSL 210.06□□□□□ -0.85e-11■■■■■ 73.8
SF3A3Q12874 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 72.7
SF3A3Q12874 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 72.7
SF3A3Q12874 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 72.7
SF3A3Q12874 ZNF317-203ENST00000419608 744 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 71.7
SF3A3Q12874 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 71.7
SF3A3Q12874 ZNF317-204ENST00000590152 2312 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 71.7
SF3A3Q12874 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 71.7
SF3A3Q12874 ZNF317-205ENST00000591278 4186 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 71.7
SF3A3Q12874 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.141e-323■■■■■ 70.6
SF3A3Q12874 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 223.14■■□□□ 1.296e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 222.89■■□□□ 1.256e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 520.86■□□□□ 0.936e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-C17orf49-204ENST00000607564 892 ntTSL 520.42■□□□□ 0.866e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.476e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.276e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.276e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-206ENST00000552321 739 ntTSL 216.54■□□□□ 0.246e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-209ENST00000575822 613 ntTSL 316.16■□□□□ 0.186e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.196e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 APRT-203ENST00000562464 515 ntTSL 316.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-211ENST00000569616 788 ntTSL 515.1■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-207ENST00000567391 667 ntTSL 312.47□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-209ENST00000568319 542 ntTSL 311.35□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-210ENST00000568575 490 ntTSL 211.35□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-208ENST00000567713 470 ntTSL 510.87□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 APRT-206ENST00000567057 437 ntTSL 210.18□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 70.1
SF3A3Q12874 MAPK3-207ENST00000466521 1878 ntTSL 530.4■■■□□ 2.462e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.462e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.322e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.792e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-214ENST00000490298 1718 ntTSL 525.34■■□□□ 1.652e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.072e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.072e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 CERK-202ENST00000443629 1760 ntTSL 1 (best)20.44■□□□□ 0.862e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 QSOX1-203ENST00000392029 1075 ntTSL 518.56■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-216ENST00000491799 733 ntTSL 318.07■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 EFTUD2-217ENST00000590124 899 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 AJAP1-203ENST00000466761 298 ntTSL 516.53■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-211ENST00000463995 1024 ntTSL 516.28■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-209ENST00000462439 829 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 215.33■□□□□ 0.052e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 RNF40-206ENST00000564260 768 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 EFTUD2-214ENST00000589769 689 ntTSL 314.89□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 214.8□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-202ENST00000399213 1636 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-208ENST00000457042 853 ntTSL 514.56□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-210ENST00000463616 699 ntTSL 314.56□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-205ENST00000447436 963 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 314.42□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-207ENST00000449966 825 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-203ENST00000442186 924 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-209ENST00000477245 3026 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-217ENST00000492581 3925 ntTSL 213.08□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-204ENST00000446089 855 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-215ENST00000483715 1055 ntTSL 311.88□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 RUVBL2-205ENST00000595002 546 ntTSL 211.15□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 ACTN1-219ENST00000556432 558 ntTSL 1 (best)11.12□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 CERK-204ENST00000471929 567 ntTSL 48.99□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 69.2
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 72.5 ms