Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnma1Q08460 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kcnma1Q08460 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kcnma1Q08460 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kcnma1Q08460 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kcnma1Q08460 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcnma1Q08460 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnma1Q08460 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnma1Q08460 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcnma1Q08460 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnma1Q08460 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnma1Q08460 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms