Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gata4Q08369 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gata4Q08369 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata4Q08369 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata4Q08369 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata4Q08369 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata4Q08369 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms